Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx8Q9QXV1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms