Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf3Q9QXK7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms