Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limd1Q9QXD8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms