Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Lsm4Q9QXA5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lsm4Q9QXA5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms