Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Homer2Q9QWW1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Homer2Q9QWW1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms