Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Csnk1eQ9JMK2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Csnk1eQ9JMK2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms