Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dclk1Q9JLM8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dclk1Q9JLM8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms