Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf19Q9JLL3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms