Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsmQ9JL96 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms