Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx5Q9JL61 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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