Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms