Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl39Q9JKF7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl39Q9JKF7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl39Q9JKF7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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