Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Uchl3Q9JKB1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uchl3Q9JKB1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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