Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pard6bQ9JK83 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pard6bQ9JK83 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms