Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms