Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnga3Q9JJZ8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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