Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scube2Q9JJS0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scube2Q9JJS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms