Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PigbQ9JJQ0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms