Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LratQ9JI60 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms