Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod3Q9JHJ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms