Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn19Q9ET38 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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