Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtofQ9ESF1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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OtofQ9ESF1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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