Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp29Q9ES63 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp29Q9ES63 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms