Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc4Q9ES56 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc4Q9ES56 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc4Q9ES56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc4Q9ES56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc4Q9ES56 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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