Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Erg28Q9ERY9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms