Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MesdQ9ERE7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MesdQ9ERE7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MesdQ9ERE7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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MesdQ9ERE7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MesdQ9ERE7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms