Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clstn2Q9ER65 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clstn2Q9ER65 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms