Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn12Q9ER56 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms