Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Barx1Q9ER42 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Barx1Q9ER42 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms