Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

Ctrl, Chymopasin, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CtrlQ9ER05 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms