Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SgshQ9EQ08 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SgshQ9EQ08 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms