Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms