Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clstn1Q9EPL2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms