Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnft1Q9DCN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnft1Q9DCN7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnft1Q9DCN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnft1Q9DCN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnft1Q9DCN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnft1Q9DCN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnft1Q9DCN7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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