Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpraQ9DBG7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms