Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmtr1Q9DBC3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms