Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Smg9Q9DB90 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smg9Q9DB90 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Smg9Q9DB90 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smg9Q9DB90 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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