Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fundc1Q9DB70 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fundc1Q9DB70 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms