Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700016D06RikQ9DAA5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms