Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ift43Q9DA69 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ift43Q9DA69 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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