Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsga13Q9DA17 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tsga13Q9DA17 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms