Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Q9D8Q6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Q9D8Q6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Q9D8Q6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Q9D8Q6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q9D8Q6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms