Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lin37Q9D8N6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin37Q9D8N6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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