Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8N1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8N1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms