Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms