Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cldn22Q9D7U6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn22Q9D7U6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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