Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Echdc3Q9D7J9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Echdc3Q9D7J9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms