Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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