Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Necab3Q9D6J4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Necab3Q9D6J4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms