Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb4aQ9D6F9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb4aQ9D6F9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms